Windows環境では常にXkeymacsを使ってemacsライクなキーバインドで生活しているのですが、Windowsの普通のショートカットキーも併用したいので、CapsLockを右Ctrlに変更して、Xkeymacs用にCapsLock(右Ctrl)を、Windows用に左Ctrlを使っています。
Windows7になってキーボードのリマップ機能がうごかなくなってしまったようなので(？)レジストリを手動で書き換えて対応しました。こんな感じです。
Windows Registry Editor Version 5.00